1587 年，豐臣秀吉命官僧安國寺慶次建造大經堂，並規定每月誦經一千遍，因此該建築被稱為「千疊閣」，意指其面積相當於 857 張榻榻米，是島上規模最大的木造建築。由於秀吉的突然去世，工程中途停工，除屋頂完成外，其餘部分至今仍未完工，連天花板也保持未加裝的原貌。
據傳在江戶時代，千疊閣已作為人們消暑、聚會的場所而深受歡迎，館內粗壯的木柱上仍可見當時歌舞伎演員及「千龍樹」等人的題名刻痕。明治時期因神佛分離政策，原本供奉的佛像被移至大願寺，建築本身則改為豐國神社，用以祭祀豐臣秀吉。
