位於金鱗湖東南畔的天祖神社,是湯布院地區一處充滿靈氣與歷史氣息的小型神社。相傳此社由日本第十二代景行天皇所建,為祭祀皇祖神靈而設,並命居於豐後國速見郡的速津媛建立。
社殿佇立於湖後方,中央主祀天祖神,右側供奉八坂神社,左側則為金比羅神社,象徵著保佑國土、驅邪避災與守護航海的信仰融合。湖面上矗立著一座石造鳥居,倒映在水面之中,當清晨薄霧籠罩時,整個湖畔彷彿進入神話世界般的夢幻境界,是湯布院最具代表性的神秘景觀之一。
神社境內還有一棵被奉為御神木的巨大杉樹,樹齡悠久,被列為大分縣的天然紀念物。石牆間湧出的清泉清澈冰涼,而造型別緻的手水舍也展現了地方匠心。
天祖神社與金鱗湖之間流傳著一則關於龍神的傳說。據說古時有一條無處棲身的龍向天祖神祈願,希望能得到安身之地,並承諾將使此地永遠湧出清泉,以守護土地與人們。天祖神遂應允其願,為龍保留了金鱗湖,成為牠的棲息之所。自此之後,湖底與神社腹地皆湧出不絕的泉水,滋養了整個由布院盆地。