毛越寺（もうつうじ）位于日本东北地区的岩手县西磐井郡平泉町，创建于9世纪中叶，是一座隶属于天台宗的重要寺院。现今的本尊为平安时代后期所造的药师如来立像，两侧侍立的是日光菩萨与月光菩萨，整体建筑风格以平安时代样式为主。
毛越寺的境内被列为国家特别史迹，庭园则被指定为特别名胜。2011年，毛越寺作为“平泉－表现佛国土（净土）的建筑、庭园及考古遗迹群”的一部分，被联合国教科文组织列入世界文化遗产名录。
毛越寺的起源可追溯至850年，由著名天台宗僧侣圆仁所创建，与同样位于平泉的中尊寺为同年建立。虽然历经大火一度荒废，但在平安时代后期，由奥州藤原氏第二代当主基衡与其子秀衡主导，对伽蓝进行了大规模重建。当时寺院规模宏大，据中世纪史书《吾妻镜》记载，境内拥有超过四十座堂塔与五百座僧房，金堂“円隆寺”金碧辉煌，装饰有金银与紫檀，被誉为“吾朝无双”，盛况一时超越中尊寺。
进入镰仓时代后，毛越寺一度受到幕府保护，但仍难逃火灾与战乱的摧毁。1226年与1573年两度遭遇火灾与兵火，寺院逐渐衰退，只剩下土坛与础石遗迹。江户时代起，毛越寺所在地区属于仙台藩，当地的伊达氏对寺院提供了一定程度的经济支持与保护。特别是在伊达政宗过世后，当时毛越寺的释迦三尊被移至其灵庙瑞凤殿旁的新建寺院——瑞凤寺供奉。
至明治时期，毛越寺展开重建工作。1899年，在南大门外新建本堂与库房；1921年更从一关城移来旧大手门作为山门。1922年毛越寺正式被指定为史迹。1954年至1959年间，进行了全面性的考古发掘，揭示出寺院原有伽蓝的规模与结构。
特别值得一提的是毛越寺的庭园设计。庭园中央的苑池保留着中岛、桥脚、庭石等原始布局，反映出典型的净土式庭园风格，是平安时代末期佛教思想与景观艺术结合的代表。发掘调查所得资料也用于绘制现今所知的“伽蓝复原图”，成为研究日本古代佛教建筑与文化的重要依据。
1989年，毛越寺本堂依照平安时代样式重建，恢复了部分昔日风貌。其后，在文化厅与岩手县的推动下，毛越寺所在的平泉地区于2001年列入世界遗产暂定名单，经过几次申请与审议后，终于在2011年获得世界遗产认证。
