毛越寺（もうつうじ）位於日本東北地區的岩手縣西磐井郡平泉町，創建於9世紀中葉，是一座隸屬於天台宗的重要寺院。現今的本尊為平安時代後期所造的藥師如來立像，兩側侍立的是日光菩薩與月光菩薩，整體建築風格則以平安時代的樣式為主。
毛越寺的境內被列為國家特別史跡，庭園則被指定為特別名勝。2011年，毛越寺作為「平泉－表現佛國土（淨土）的建築、庭園及考古遺跡群」的一部分，被聯合國教科文組織列入世界文化遺產名錄。
毛越寺的起源可追溯至850年，由著名的天台宗僧侶圓仁所創建，與同樣位於平泉的中尊寺為同年建立。雖然歷經大火一度荒廢，但在平安時代後期，由奧州藤原氏第二代當主基衡與其子秀衡主導，對伽藍進行了大規模重建，當時寺院規模宏大，據中世史書《吾妻鏡》記載，境內擁有超過四十座堂塔與五百座僧房，金堂「円隆寺」金碧輝煌，裝飾有金銀與紫檀，被譽為「吾朝無雙」，盛況一時超越中尊寺。
進入鎌倉時代後，毛越寺一度受到幕府的保護，但仍難逃火災與戰亂的摧毀。1226年與1573年兩度遭遇火災與兵火，寺院逐漸衰退，只剩下土壇與礎石遺跡。江戶時代起，毛越寺所在的地區屬於仙台藩，當地的伊達氏對寺院提供了一定程度的經濟支持與保護。特別是在伊達政宗過世後，當時毛越寺的釋迦三尊被移至其靈廟瑞鳳殿旁的新創寺院——瑞鳳寺供奉。
至明治時期，毛越寺展開重建工作。1899年，在南大門外新建本堂與庫裡；1921年更從一關城移來舊大手門作為山門。1922年毛越寺正式被指定為史跡。1954年至1959年間，進行了全面性的考古發掘，揭示出寺院原有伽藍的規模與結構。
特別值得一提的是毛越寺的庭園設計。庭園中央的苑池保留著中島、橋腳、庭石等原始布局，反映出典型的淨土式庭園風格，是平安時代末期佛教思想與景觀藝術結合的代表。發掘調查所得資料也用於繪製現今所知的「伽藍復原圖」，成為研究日本古代佛教建築與文化的重要依據。
1989年，毛越寺本堂依據平安時代樣式重建，恢復了部分昔日風貌。其後，在文化庁與岩手縣的推動下，毛越寺所在的平泉地區於2001年列入世界遺產暫定名單，經過幾次申請與審議後，終於在2011年獲得世界遺產認證。
